公司在宝山经济开发区报税，首要的是培养员工的税务合规意识。这包括税法法规的学习和理解，以及税务申报的程序和要求。在公司内部，可以通过定期举办税务培训课程，邀请税务专家为员工讲解相关法规和政策，加深员工对税务合规的认识。
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此外，建立内部的税务合规监督机制也至关重要。公司可以设立专门的税务合规部门或者委派专人负责监督税务申报流程，确保申报过程合规、准确。
另外，公司还应该建立健全的奖惩机制，对于税务合规方面表现突出的员工给予奖励，对于违反税法规定的员工进行相应处罚，以此来促进税务合规意识的形成和落实。
为了防止税务违法问题的发生，公司需要建立完善的内部控制机制。首先，应该建立起完善的财务管理制度和流程，确保税务申报的准确性和及时性。这包括财务数据的记录和核对、报表的编制和审查等环节。
其次，公司应该建立起严格的审计制度，定期对财务数据和税务申报情况进行审计和检查，及时发现和纠正问题，避免税务违法行为。
此外，建立起风险管理体系也是必不可少的。公司需要对税务风险进行全面评估，制定相应的风险防范措施，及时应对可能出现的税务问题。
除了内部控制机制，公司还应该加强税务合规的外部监管。这包括加强与税务部门的沟通和合作，及时了解税务政策和法规的变化，确保公司的税务申报符合最新的要求。
同时，公司可以委托专业的税务顾问或律师团队，对税务申报情况进行全面审查和咨询，帮助公司避免税务风险，确保税务合规。
另外，公司还可以积极参与税务政策的制定和修订过程，向政府部门提出建议和意见，为公司的税务合规提供更多的保障。
最后，公司还需要加强对员工的教育和监督。这包括加强对员工的税法法规培训，提高他们的税务合规意识，以及建立起严格的内部监督机制，对员工的税务申报行为进行监督和检查。
同时，公司可以建立举报制度，鼓励员工对税务违法行为进行举报，保护举报人的合法权益，及时发现和处理税务违法问题。
通过以上措施的综合实施，公司可以有效预防和处理在宝山经济开发区报税过程中可能出现的税务违法问题，确保公司的经营活动合法合规。
综上所述，公司在宝山经济开发区报税，要处理税务违法问题，需要从税务合规意识培养、内部控制机制建立、加强税务合规监管和加强员工教育和监督等方面入手，综合运用各种手段和措施，确保税务申报的准确性和合规性，为公司的可持续发展提供保障。
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